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对于咳嗽之病因，《 素问》 咳论早有所论述：“皮毛者，肺之合也，皮毛先受邪气，邪气以从其合也。其寒饮食入胃，从肺脉上至于肺则肺寒，肺寒则外内合邪，因而客之，则为肺咳。”指出外邪从皮毛侵肺，内邪从胃上侵肺，为咳嗽形成之主因。他篇亦屡言肺受邪，肝木受邪，邪害心火，及热淫、燥淫、炎暑、伤湿、肺风，皆能致咳逆，实已道及风、寒、热、暑、湿、燥六淫之邪为咳嗽之外因，故张子和在其所著“嗽有六气，毋拘以寒说”中，历举《 内经》 所述各淫引起之咳嗽证状以为证。喻嘉言亦谓：“六气主病，风、寒、热、暑、湿、燥皆能乘肺，皆能致咳。”至于咳嗽之内因，咳论除指出寒饮入肺为肺咳外，复指出“五脏六腑皆令人咳，非独肺也。分并就五脏六腑十一种咳之传变证状，一一叙列，实为后世论内伤咳嗽之所本。至隋巢元方《 诸病源候论》 孙思邀之《 千金要方》 俱谓咳有十种：即风咳咳、支咳、肝咳、心咳、脾咳、肺咳、肾咳、胆咳及厥阴咳。清沈金鳌论嗽，更分为十六种：即风嗽、热嗽痰嗽、湿嗽干嗽、郁嗽、血嗽、劳嗽、食积嗽、酒嗽、寒气，久嗽、火嗽、夜嗽、天行嗽，虽搜罗颇为详备，而内因外因杂陈，意义不够明确。故一般医家对于咳嗽病因之探索，多以外感内伤为两大纲，如明戴思恭《 证治要诀》 谓，“咳嗽为病，有自外而入者，有自内而发者，风寒暑湿，外也，七情饥饱，内也。风寒暑湿先自皮毛而入，皮毛者，肺之合，故虽外邪欲传脏腑，亦必先从其合而为嗽，此自外而入者也；七情饥饱，内有所伤，则邪气上逆，肺为气出入之道，故五脏之邪上蒸于肺而为咳一此自内而发者也。然风寒暑湿有不为嗽者，盖所感者重，径伤脏腑，不留于皮毛；七情亦有不为嗽者，盖病尚浅，止在本脏，未即上攻。所以伤寒以有嗽为轻，而七情饥饱之嗽，久而复见。”张景岳亦说：“咳嗽一证，窃见诸家立论太繁，多致后人临证，莫知所从，所以治难得效。以余观之，则咳嗽之要，止惟二证，何谓二证？一曰外感，一曰内伤，而尽之矣。夫外感之咳，必由皮毛而入，盖皮毛为肺之合，而凡外邪袭之，则必先入于肺，久而不愈，则必自肺而传于五脏也；内伤之咳，必起于阴分，盖肺属燥金，为水之母，阴损于下，则阳孤于上，水涸金枯，肺苦于燥，肺燥则痒，痒则咳不能已也。总之咳证虽多，无非肺病，而肺之为病，亦无非此二者而已。但于此二者之中，当辨阴阳，分虚实耳。”所论肯简捷明白，条理分明。惟一则外感遗燥热二证，一则内伤仅着重于阴分，亦不可谓为赅备。而均指出病之重点在肺，并提及内外上下传变及阴阳虚实之辨，则皆精要可从。清陈修园亦谓：“咳嗽证，表里寒热虚实皆能致之，最为虚损大关头，然泛而求之，条绪纷繁，连篇累犊不能尽也。”亦主张由博返约，可见咳嗽之病因，实以外感内伤立论为最当。即宋陈无择《 三因方》 所说致咳之不内外因，如房劳伤肾，饥饱伤脾，疲极伤肝，叫呼伤肺，劳神伤心等，亦不过七情饥饱内伤之范畴，实无须另行立说。
现代医学日新月异，对予咳嗽之致病因素，愈益明确。归纳起来，不外理化因素，菌毒感染，过敏因素，神经反射性，及其它某些疾病所引起。综观历代医家之论述，对此诸项亦已具体而微地触及。理化因素中最重要者为气候的变化，《 内经》 所说风、寒、暑、湿、燥、火六淫之邪，实已包括温度、湿度、风向、日照、降水及四时节序变迁影响而言。其次，所谓菌毒感染，亦与气候变化及人体抗力有关，《 内经》 谓“正气存内，邪不可干。”“邪之所凑，其气必虚。”外因通过内因而起作用，菌毒每随气候骤变而侵及抵抗力弱之人，而且互相感染。《 内经》 所说“四时皆有疫病”，以及后世关于天行、时邪、瘟疫、病毒、疥虫、尸痉、传注灭门等之论述，皆属此类（许多时行病，用药如银花，连翘、黄琴、蒲公英、鱼腥草、板蓝根等，据实验俱有杀灭菌毒作用，且有些效力强于抗菌药物而少副作用，可为反证）。至于尘埃异物秽气，及过敏原刺激呼吸道而致咳，前肠引“肺为清虚之府，一物不容，毫毛必咳。”及“肺为娇脏，遇寒则咳，遇热则咳”，似已论及。神经因子引起的咳嗽，如“皮肤受凉时反射性地引起咳嗽”, 则与“肺合皮毛”, “邪侵肺卫”之说扣合，各种内脏刺激亦能反射性地引起咳嗽，则与喜、怒、忧、思、悲、恐，惊，七情之咳嗽，其它脏腑传变上逆之咳嗽相近。足见各种致病因素，俱不出外感‘内伤两大范围。至于每一病证之具体原因，则须于临证时结合证状，细致推求，始能确定，而据以论治。
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